Las 4 mejores pasarelas de pago para Latinoamérica en 2026, comparadas

Esta guía es para negocios que están comparando pasarelas de pago antes de contratar una: una tabla comparativa, y luego un análisis más de cerca de cada opción, con la comisión real, en qué países opera, y para quién tiene sentido.

Respuesta rápida: Mercado Pago cobra 3.50% + IVA sobre la comisión por tarjeta en México (3.49% + $4 MXN en checkout online), Clip cobra 2.99% + $1 MXN + IVA en su tasa promocional actual (3.6% + IVA en la tasa estándar), PayU cobra alrededor de 3.29-3.49% + una cuota fija en Colombia, y EBANX no publica una tarifa fija, funciona con cotización personalizada para pagos transfronterizos en más de 15 países. Si además quieres vender y cobrar directo por WhatsApp, el CRM de Mavibot ya se conecta con Mercado Pago y Clip.

Qué mirar antes de elegir una pasarela de pago

La comisión anunciada casi nunca es el número final. El IVA se calcula sobre la comisión, no sobre el monto de la venta, así que una tasa de 3.6% termina siendo más alta en la práctica. Meses sin intereses, el tipo de método de pago (tarjeta, transferencia, efectivo) y si cobras con terminal física o en línea también cambian la tasa real.

La segunda pregunta importante: la pasarela cubre solo un país, o varios. Clip es México únicamente. Mercado Pago y PayU operan en varios países de la región, cada uno con su propia tabla de comisiones local. EBANX se especializa justamente en cobrar en varios países a la vez, sin que el negocio tenga que dar de alta una cuenta en cada uno.

Tabla comparativa: mejores pasarelas de pago para Latinoamérica

1. Mercado Pago: la cobertura más amplia de la región

Características principales

Mercado Pago, el brazo de pagos de Mercado Libre, opera en Argentina, Brasil, México, Chile, Colombia, Perú y Uruguay, cada país con su propia app, comisión y métodos de pago locales (SPEI en México, PIX en Brasil, transferencias en Argentina). Acepta tarjetas, transferencias, efectivo y su propio saldo.

Comisión

En México, la tasa estándar por tarjeta es 3.50% + IVA sobre la comisión (no sobre la venta), y en checkout online con transferencia SPEI o saldo de Mercado Pago la tasa es 3.49% + $4 MXN, según el propio blog de Mercado Pago México. La comisión exacta cambia según el país, el método de cobro y si ofreces meses sin intereses.

Pros y contras

Pros:

• Opera en siete países de la región, cada uno con métodos de pago locales ya integrados
• Marca muy reconocida, la mayoría de los compradores ya confían en ella
• Ya se conecta directamente al CRM de Mavibot para cobrar por WhatsApp

Contras:

• La comisión varía país por país, hay que revisar la tabla local antes de asumir un número
• El IVA se calcula sobre la comisión, no sobre la venta, lo que sube el costo efectivo

Mejor para: negocios que venden en más de un país de Latinoamérica y quieren una sola pasarela reconocida en toda la región.

¿Quieres cobrar Mercado Pago directo por WhatsApp?

El panel de Mercado Pago es sólido para ver el historial de ventas, pero cobrar por WhatsApp requiere generar el link manualmente. El CRM de Mavibot se conecta directamente con Mercado Pago, así que el bot genera el link de pago dentro de la conversación y el cliente paga sin salir de WhatsApp. La documentación de esta integración está en portugués (se construyó primero para el mercado brasileño), pero la conexión con Mercado Pago funciona igual sin importar el idioma de tu tienda.

2. Clip: la opción más simple si vendes solo en México

Características principales

Clip es una fintech mexicana con terminales físicas, pagos en línea, links de pago y códigos QR, todo bajo el mismo ecosistema, según clip.mx. No cobra cuota mensual fija, la comisión se descuenta de cada venta.

Comisión

La tasa promocional actual es 2.99% + $1 MXN + IVA por transacción con terminal, frente a la tasa estándar de 3.6% + IVA. Para pagos en línea y links de pago, Clip no publica una tasa fija.

Pros y contras

Pros:

• Tasa promocional (2.99% + $1 MXN + IVA) más baja que la estándar de Mercado Pago en México
• Sin cuota mensual fija por usar el servicio
• Ya se conecta directamente al CRM de Mavibot para cobrar por WhatsApp

Contras:

• Solo funciona en México, no sirve si vendes en otros países de la región
• Sin tarifa pública para pagos en línea, solo para terminal física

Mejor para: negocios que venden únicamente en México y quieren la tasa promocional más baja de esta lista.

3. PayU: fuerte en Colombia, presente en toda la región

Características principales

PayU tiene sede en Colombia y opera en Argentina, Brasil, Chile, Colombia, México, Perú y Centroamérica. Su cobertura de métodos de pago incluye tarjetas, PSE, y pagos en efectivo como Baloto y Efecty en Colombia, según comparativas actualizadas de 2026.

Comisión

En Colombia, la tarifa estándar ronda 3.29-3.49% + una cuota fija en pesos colombianos por transacción, más IVA, con montos mínimos según el medio de pago. La comisión exacta varía según el país y el volumen negociado.

Pros y contras

Pros:

• Presencia sólida en siete países, útil si ya operas en varios mercados de la región
• PSE en Colombia suele salir más barato que el pago con tarjeta
• Condiciones negociables para negocios con volumen alto

Contras:

• No se conecta directamente al CRM de Mavibot, cobrar por WhatsApp requiere un paso manual
• La comisión exacta no siempre es fácil de encontrar sin pedir cotización

Mejor para: negocios ya establecidos en Colombia u otros países donde PayU tiene presencia fuerte, especialmente con volumen para negociar condiciones.

4. EBANX: la opción para cobrar en varios países sin darte de alta en cada uno

Características principales

EBANX se especializa en pagos transfronterizos: un negocio se conecta una sola vez y puede cobrar con métodos de pago locales en más de 15 países de Latinoamérica, incluyendo PIX en Brasil, OXXO en México y Yape en Perú.

Comisión

EBANX no publica una tabla de tarifas fija, el modelo es de cotización personalizada según volumen, países y métodos de pago. Para negocios pequeños con bajo volumen, esto puede significar un proceso de alta más largo que con Clip o Mercado Pago.

Pros y contras

Pros:

• Un solo contrato para cobrar con métodos de pago locales en 15+ países
• Pensado específicamente para cross-border, útil si vendes desde fuera de la región
• Métodos de pago locales relevantes (PIX, OXXO, Yape) sin integrarlos uno por uno

Contras:

• Sin tarifa pública, hay que pasar por una cotización comercial antes de saber el costo real
• Pensado más para negocios con volumen medio-alto que para una tienda pequeña que recién empieza

Mejor para: negocios que venden a varios países de Latinoamérica a la vez, o empresas fuera de la región que quieren cobrar con métodos de pago locales sin integrar cada país por separado.

Conclusión: si vendes solo en México y quieres la tasa más baja, Clip con su tasa promocional gana. Si vendes en varios países y quieres una sola marca reconocida en toda la región, Mercado Pago es la opción más amplia. Si tu negocio ya tiene volumen en Colombia, PayU tiene presencia fuerte ahí. Y si necesitas cobrar en muchos países sin darte de alta en cada uno por separado, EBANX está pensado justo para eso. Para cobrar directo por WhatsApp sin generar el link a mano, Mercado Pago y Clip son, de las cuatro, las que ya se conectan al CRM de Mavibot.

Lo que la comisión inicial no siempre deja ver

Cada pasarela de esta lista tiene una tasa de entrada, pero "tasa de entrada" no significa lo mismo en cada una.

• Mercado Pago: 3.50% + IVA es la tasa de tarjeta en México, pero cada país tiene su propia tabla, y ofrecer meses sin intereses sube el costo.
• Clip: la tasa promocional de 2.99% + $1 MXN + IVA es más baja que la estándar de 3.6% + IVA, pero no hay tarifa pública para pagos en línea.
• PayU: el rango de 3.29-3.49% + cuota fija es para Colombia, otros países de la región pueden tener tablas distintas.
• EBANX: sin tarifa pública en absoluto, el costo real depende de una cotización según volumen y países.

Preguntas frecuentes

¿Cuál es la mejor pasarela de pago para Latinoamérica?

Depende de dónde vendes. Si solo vendes en México, Clip tiene la tasa promocional más baja de esta lista. Si vendes en varios países, Mercado Pago tiene la cobertura más amplia con una sola marca. Si necesitas cobrar en muchos países sin integrarlos uno por uno, EBANX está diseñado justo para eso.

¿Mercado Pago o Clip, cuál conviene más?

Depende de dónde vendes y qué tan alto es tu volumen. Clip, con su tasa promocional de 2.99% + $1 MXN + IVA, suele salir más barato que la tasa estándar de Mercado Pago en México (3.50% + IVA), pero Clip solo funciona en México, mientras Mercado Pago cubre siete países de la región.

¿Qué pasarela de pago tiene la comisión más baja?

En esta lista, la tasa promocional de Clip (2.99% + $1 MXN + IVA) es la más baja publicada, pero aplica solo a pagos con terminal física en México. PayU y EBANX no publican tarifas fijas para comparar directamente.

¿Puedo cobrar con estas pasarelas directo por WhatsApp?

Mercado Pago y Clip ya se conectan directamente al CRM de Mavibot, así que el bot genera el link de pago dentro de la conversación de WhatsApp. PayU y EBANX no tienen esa integración hoy.

Cobra por WhatsApp sin salir de la conversación

Cada canal que ya manejas con Mavibot, WhatsApp, Instagram, Telegram, chat del sitio, cae en el mismo registro del cliente. Conectando Mercado Pago o Clip, cobrar también funciona así: sin generar el link a mano, sin que el cliente salga de la conversación. Empieza gratis con Mavibot y conecta tu cuenta hoy.